Afgezien daarvan blijft het een problematisch geheel. Er zijn veel globale beschrijvingen van één inventarisnummer waarbij veel stukken op een hoop gegooid zijn zonder nadere ordening. Anderzijds zijn er inventarisnummers, veelal rekeningen, die deel uitmaken van een band. Eén materiële eenheid is dan gesplitst in een aantal nummers.
De indeling klopt vaak niet. Rubrieken zijn soms niet duidelijk aangegeven of stukken zitten in de verkeerde rubriek. Sommige rubrieken zijn veel te lang; vaak ontbreekt een ordeningsprincipe. Bij de rekeningen zijn vaak in plaats van rubrieken verzamelbeschrijvingen gebruikt van twee tot drie niveaus diep.
De inhoud van de stukken komt niet altijd overeen met de beschrijvingen.
In de huidige versie zijn de ergste problemen opgelost. In 2011 is een aantal ongeïnventariseerde stukken alsnog beschreven.